Desde el pasado 20 de diciembre, Mercabarna tiene un nuevo presidente a raíz de los cambios en el gobierno municipal de Barcelona. El nuevo presidente es Agustí Colom, de Barcelona en Comú y regidor de Empresa y Turismo y Comercio y Mercados del Ayuntamiento de Barcelona, que sustituye a la hasta ahora presidenta Montserrat Ballarín (PSC), que ha ejercido este cargo desde julio de 2016.