Actualmente, Mercabarna cuenta con la acreditación para impartir 7 certificados de profesionalidad relacionados con la manipulación y venta de productos alimenticios.

Mercabarna ha sido el primer centro en homologarse para impartir el Certificado de Profesionalidad de Pescadería y elaboración de productos de la pesca y la acuicultura y, actualmente, es el único autorizado en Cataluña. Para esta formación, cuenta con una nueva aula donde se imparten los contenidos prácticos y que está ubicada dentro de la empresa Moray Fish.

Con este ya son 7 los Certificados que puede impartir Mercabarna, entre los que está el de Sacrificio, faenado y despiece de animales, Actividades de venta, Actividades de floristería, Actividades auxiliares de comercio, Actividades auxiliares de almacén y Actividades auxiliares de floristería.

Las empresas de Mercabarna que estén interesadas pueden acoger en prácticas a los alumnos que hacen cualquiera de estos cursos. Se pueden consultar los periodos de prácticas en el apartado "Acoge alumnos en prácticas" de la web de Mercabarna.